В ковчеге находятся:
- Часть Животворящего Креста Господня,
- часть Гроба Господня,
- часть Голгофы,
- часть Гроба Божией Матери,
- Часть Престола последних уз Христовых,
- камень из стены темницы Спасителя,
- часть ступени Ирода, через которую вели Спасителя на казнь,
- часть ступени, через которую Спаситель вошёл в Иерусалим на вольные Страдания,
- часть оливы из Гефсиманского сада,
- часть камня, с которого вознёсся Спаситель,
- часть камня, на котором совершалось моление о Чаше,
- камень из реки Иордан,
- камень из стены вертепа, в котором родился Спаситель,
- камень с горы Фавор, с места Преображения Господня,
- камень из стены грота Божией Матери,
- камень из стены дома Иоакима и Анны с места Рождества Пресвятой Богородицы,
- камень из стены Сионской горницы,
- камень из стены пещеры пророка Илии,
- часть Мамврийского дуба.
- Частицы гробниц святых. Царя Давида, создателя Псалтири
- праведных Богоотец Иоакима и Анны,
- Лазаря Четверодневного,
- праведной Тавифы,
- блаженного Иеронима,
- преподобного Саввы Освященного,
- пастухов Вифлеемских,
- младенцев Вифлеемских,
- праотцев Авраама, Сарры, Исаака и Ревекки,
- преподобного Иоанна Мосха,
- блаженной Параскевы,
- преподобномученицы Марии Гатчинской,
- часть купели из Херсонеса, в которой крестился великий князь Владимир Киевский.
- Частицы мощей святых. Апостола Андрея Первозванного,
- исповедника Иоанна Русского,
- преподобного Аристоклия Афонского,
- одного из отроков Ефесских,
- одного из мучеников Мангупских,
- преподобного Корнилия Крыпецкого,
- преподобного Феодора Санаксарского,
- преподобноисповедника Александра Санаксарского,
- праведного адмирала Феодора Ушакова.
- Камень из стены храма, в котором погребён апостол Филипп
- Камень из стены храма в Мирех Ликийских, где служил и был погребён Святитель Николай Другие святыни в храме Святых апостолов Петра и Павла в Вырице
(410)